Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rrp36Q3UFY0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rrp36Q3UFY0 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms