Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Puf60Q3UEB3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Puf60Q3UEB3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms