Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Ttll12Q3UDE2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Ttll12Q3UDE2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms