Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Cops9Q3U898 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Cops9Q3U898 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms