Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Q3U6N9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Q3U6N9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Q3U6N9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms