Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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