Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Otud5Q3U2S4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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