Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc174Q3U155 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc174Q3U155 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms