Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hace1Q3U0D9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hace1Q3U0D9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms