Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rufy4Q3TYX8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rufy4Q3TYX8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms