Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
1700066B19RikQ3TS39 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
1700066B19RikQ3TS39 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms