Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CiartQ3TQ03 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CiartQ3TQ03 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms