Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp4cQ3TKR3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp4cQ3TKR3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms