Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2afvQ3THW5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2afvQ3THW5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms