Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc69Q3TCJ8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms