Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms