Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccbe1Q3MI99 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccbe1Q3MI99 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms