Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Riiad1Q3KNY5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Riiad1Q3KNY5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms