Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2-M3Q31093 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2-M3Q31093 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms