Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hdgfl1Q2VPR5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hdgfl1Q2VPR5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 215.5 ms