Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vax1Q2NKI2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms