Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
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Shroom4Q1W617 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.8
Shroom4Q1W617 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Shroom4Q1W617 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
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