Protein–RNA interactions for Protein: Q148W0

Atp8b1, Phospholipid-transporting ATPase IC, mousemouse

Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b1Q148W0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atp8b1Q148W0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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