Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ccdc162pQ0VG85 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ccdc162pQ0VG85 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms