Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ttc39dQ0VF76 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms