Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cpne7Q0VE82 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cpne7Q0VE82 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms