Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rundc1Q0VDN7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rundc1Q0VDN7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms