Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBM2

Fam83b, Protein FAM83B, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83bQ0VBM2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam83bQ0VBM2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam83bQ0VBM2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms