Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms