Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ubxn2bQ0KL01 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ubxn2bQ0KL01 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms