Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff1Q08423 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tff1Q08423 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tff1Q08423 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tff1Q08423 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tff1Q08423 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tff1Q08423 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Tff1Q08423 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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