Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gata4Q08369 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms