Protein–RNA interactions for Protein: Q08297

Rad51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51Q08297 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rad51Q08297 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rad51Q08297 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms