Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gdf9Q07105 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gdf9Q07105 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms