Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Siah2Q06986 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms