Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox4Q06831 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox4Q06831 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms