Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atf4Q06507 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf4Q06507 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms