Protein–RNA interactions for Protein: Q05A36

Mex3c, RNA-binding E3 ubiquitin-protein ligase MEX3C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mex3cQ05A36 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mex3cQ05A36 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mex3cQ05A36 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms