Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnd1Q03719 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnd1Q03719 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms