Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Kcnb1Q03717 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms