Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Msx2Q03358 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms