Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cacna1sQ02789 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cacna1sQ02789 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms