Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nhlh1Q02576 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nhlh1Q02576 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms