Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pdcd1Q02242 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pdcd1Q02242 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms