Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PrkcqQ02111 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PrkcqQ02111 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms