Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nme2Q01768 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms