Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Mc1rQ01727 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms