Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Top2aQ01320 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Top2aQ01320 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms