Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
HmgcrQ01237 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HmgcrQ01237 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms