Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Gjb2Q00977 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Gjb2Q00977 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms